Хани Кисараги учится в католической школе, следит за модой и наверняка знает, где в Токио подают лучшие сладости. Тихая жизнь заканчивается, когда на её глазах погибает отец, а из его последней записки выясняется странное: Хани не человек. Она андроид, внутри неё спрятан манипулятор элементарных частиц. Убийцы из «Когтя пантеры» явно не ожидали, что скромная школьница окажется боевой единицей, способной менять облик быстрее, чем директриса мисс Хистлер успеет поправить очки.

Дальше начинается странная мешанина из перестрелок, переодеваний и школьных будней. Днём Хани отсиживает уроки, а ночью прорывается сквозь ряды солдат «Когтя», чтобы добраться до зловещей Сестры Джилл. Друзья прикрывают её, но чем ближе развязка, тем чаще встаёт вопрос: где заканчивается девочка и начинается машина.

Кто же на самом деле управляет телом Хани, когда манипулятор включается на полную?